Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAX2Q96IS3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAX2Q96IS3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms