Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRRFQ96E11 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRRFQ96E11 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRRFQ96E11 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRRFQ96E11 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRRFQ96E11 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRRFQ96E11 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRRFQ96E11 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms