Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RGP1Q92546 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms