Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VWDEQ8N2E2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VWDEQ8N2E2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms