Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP34Q70CQ2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP34Q70CQ2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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