Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RBM43Q6ZSC3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms