Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO38Q6PIJ6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO38Q6PIJ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms