Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGNBP1Q5YKI7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GGNBP1Q5YKI7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms