Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ANKRD39Q53RE8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms