Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms