Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC36A3Q495N2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC36A3Q495N2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC36A3Q495N2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC36A3Q495N2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC36A3Q495N2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC36A3Q495N2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC36A3Q495N2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC36A3Q495N2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC36A3Q495N2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC36A3Q495N2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms