Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SIX1Q15475 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIX1Q15475 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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