Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDCD1Q15116 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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