Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTK7Q13308 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTK7Q13308 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTK7Q13308 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms