Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SCGB2A2Q13296 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SCGB2A2Q13296 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SCGB2A2Q13296 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SCGB2A2Q13296 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SCGB2A2Q13296 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SCGB2A2Q13296 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCGB2A2Q13296 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SCGB2A2Q13296 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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