Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC173Q0VFZ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms