Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLFN5Q08AF3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLFN5Q08AF3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms