Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PLOD1Q02809 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms