Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1DQ01668 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms