Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK5Q00535 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK5Q00535 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms