Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CBX1P83916 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CBX1P83916 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CBX1P83916 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CBX1P83916 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CBX1P83916 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CBX1P83916 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CBX1P83916 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CBX1P83916 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CBX1P83916 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX1P83916 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX1P83916 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX1P83916 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX1P83916 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX1P83916 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX1P83916 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX1P83916 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CBX1P83916 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms