Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIP4K2BP78356 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2BP78356 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms