Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms