Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ABCE1P61221 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms