Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRE11P49959 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRE11P49959 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRE11P49959 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRE11P49959 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms