Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GSK3BP49841 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms