Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NESP48681 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NESP48681 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NESP48681 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NESP48681 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NESP48681 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NESP48681 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NESP48681 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NESP48681 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NESP48681 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NESP48681 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
NESP48681 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NESP48681 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NESP48681 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NESP48681 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NESP48681 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NESP48681 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
NESP48681 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NESP48681 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
NESP48681 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NESP48681 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NESP48681 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NESP48681 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NESP48681 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NESP48681 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NESP48681 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NESP48681 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NESP48681 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NESP48681 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NESP48681 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NESP48681 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NESP48681 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NESP48681 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NESP48681 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NESP48681 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NESP48681 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NESP48681 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NESP48681 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NESP48681 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NESP48681 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NESP48681 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NESP48681 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NESP48681 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NESP48681 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms