Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP5P45974 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP5P45974 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP5P45974 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP5P45974 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP5P45974 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP5P45974 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP5P45974 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP5P45974 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
USP5P45974 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP5P45974 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP5P45974 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP5P45974 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms