Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A5P29400 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms