Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5AP29375 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5AP29375 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms