Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT1P21579 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT1P21579 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms