Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCP20941 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCP20941 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCP20941 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCP20941 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCP20941 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms