Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCL3L1P16619 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL3L1P16619 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms