Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTN1P12814 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms