Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2AFB1P0C5Y9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms