Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TYMSP04818 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TYMSP04818 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms