Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB1P04280 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB1P04280 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB1P04280 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB1P04280 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB1P04280 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRB1P04280 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRB1P04280 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRB1P04280 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRB1P04280 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRB1P04280 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRB1P04280 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRB1P04280 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRB1P04280 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRB1P04280 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRB1P04280 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRB1P04280 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms