Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DENRO43583 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DENRO43583 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DENRO43583 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DENRO43583 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DENRO43583 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DENRO43583 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DENRO43583 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DENRO43583 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DENRO43583 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DENRO43583 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DENRO43583 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DENRO43583 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DENRO43583 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DENRO43583 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms