Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYNJ1O43426 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SYNJ1O43426 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms