Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLRMTO00411 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms