Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCBP2LA6PVI3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCBP2LA6PVI3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms