Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MYO1H-201ENST00000310903 4364 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 EGFLAM-201ENST00000322350 4411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SUN3-202ENST00000395572 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PAX6-282ENST00000640975 2553 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PHTF2-205ENST00000416283 5198 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SCN5A-208ENST00000450102 6284 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NEPRO-202ENST00000383675 4672 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SCN10A-201ENST00000449082 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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