Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF304-202ENST00000391705 4313 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DLG2-218ENST00000524982 2872 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PTCH1-206ENST00000421141 7659 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TRPM3-211ENST00000396280 4671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC115837.1-201ENST00000517662 1001 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 SYNPO2-201ENST00000307142 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL359076.1-201ENST00000426860 420 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 PTAFR-203ENST00000539896 4191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF611-219ENST00000602162 3299 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 TRIM60P19-201ENST00000452879 1462 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 ZNF91-201ENST00000300619 5489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC1Q15751 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms