Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ZSWIM2-201ENST00000295131 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 STEAP3-AS1-201ENST00000454260 3218 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 TARS-204ENST00000502553 2534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SYT14-202ENST00000367019 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 HHAT-202ENST00000367009 2714 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SPDYE3-201ENST00000332397 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 LRIT2-202ENST00000538192 3177 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CCL14-201ENST00000614009 3265 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 MLLT3-209ENST00000629733 3264 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AL445665.1-201ENST00000322495 2599 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PPARGC1B-204ENST00000403750 3146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC097375.3-201ENST00000515329 2652 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SLC26A8-208ENST00000490799 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CAVIN2-201ENST00000304141 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD42-204ENST00000526731 3230 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SP140-204ENST00000417495 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 MGC15885-201ENST00000558940 2425 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 LOXL3-201ENST00000264094 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 EFHC1-214ENST00000636107 3530 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 MYO1A-201ENST00000300119 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 IFT122-202ENST00000347300 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 MICAL2-217ENST00000527546 3358 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF30-201ENST00000303586 2579 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SNX20-201ENST00000300590 3304 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 KCND1-202ENST00000376477 3306 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 METTL4-201ENST00000319888 3601 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP20-1Q3LI63 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms