Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 U3.48-201ENST00000363172 216 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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