Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms