Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPRKBQ9Y3C4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms