Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNQ9UQP3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms