Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA1024Q9UPX6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA1024Q9UPX6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms