Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
REREQ9P2R6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
REREQ9P2R6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
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